Территория заказника охватывает часть бассейна реки Тайдон и значительную часть Салтымаковского хребта. В низкогорьях хребта Кузнецкого Алатау заказник граничит с охранной зоной государственного природного заповедника «Кузнецкий Алатау». Салтымаковский заказник создан как видовой в целях охраны и воспроизводства лося. Преобладает темнохвойная тайга (пихта и кедр), значительные участки заняты вторичными лесами – березово-осиновым мелколесьем на зарастающих вырубках и гарях. Флора и фауна. Фауна заказника содержит 37 видов позвоночных и 4 вида беспозвоночных животных, включенных в Красную Книгу Кемеровской области. Состав флоры заказника формирует 546 видов высших сосудистых растений, относящихся к 96 семействам и 301 роду. Сосудистые споровые растения (хвощи, плауны, папоротники) представлены 21 видом, из них папоротников 14 видов.
| 1. | Калихман, Т. П. Атлас особо охраняемых природных территорий Сибирского федерального округа [Текст] / Т. П. Калихман, В. Н. Богданов, Л. Ю. Огородникова. – Иркутск : Изд-во Оттиск, 2012. – 384 с. |
| 2. | Красная книга Кемеровской области. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды растений и грибов = Red Data Book of the Kemerowo territory. Rare and disappearing plant and fungus species [Текст] / [отв. ред. И. М. Красноборов ; авт.-сост.: А. Т. Мальцева и др.]. – Кемерово : Кемеровское книжное издательство, 2000. – 248 с. : ил. |
| 3. | Красная книга Кемеровской области. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды животных = Red Data Book of the Kemerowo territory. Rare and endangered species of animals [Текст] / [отв. ред.: Т. Н. Гагина, Н. В. Скалон]. – Кемерово : Кемеровское книжное издательство, 2000. – 276 с. : ил. |
| 1. | Государственный природный зоологический заказник «Салтымаковский» [Электронные данные] // Экология и природные ресурсы Кемеровской области. – Электрон. дан, 2017- . – Режим доступа: http://ecokem.ru. – Загл. с экрана.. |
| 2. | Государственный природный зоологический заказник «Салтымаковский» [Электронный ресурс] // Государственное казенное учреждение «Дирекция особо охраняемых природных территорий Кемеровской области». – Электрон. дан. – Кемерово, 2012. – Режим доступа: http://dooptko.ru. – Загл. с экрана. |
| 3. | Доклад о состоянии и охране окружающей среды Кемеровской области в 2015 году [Электронный ресурс] // Департамент природных ресурсов и экологии Кемеровской области. – Электрон. дан. (1 файл : 30,5 МБ). – Режим доступа: http://kuzbasseco.ru. – Загл. с экрана.. |
| Латинское название | Русское название | Категория охраны |
| Falco cherrug Gray, 1834 | Балобан | 1 |
| Aquila chrysaetos (Linnaeus, 1758) | Беркут | 1 |
| Murina leucogaster Milne-Edwards, 1872 | Большой трубконос | 3 |
| Limosa limosa (Linnaeus, 1758) | Веретенник большой | 2 |
| Botaurus stellaris (Linnaeus, 1758) | Выпь большая | 3 |
| Falco columbarius (Linnaeus, 1758) | Дербник | 3 |
| Falco vespertinus (Linnaeus, 1766) | Кобчик | 1 |
| Vespertilio murinus (Linnaeus, 1758) | Кожан двуцветный | 3 |
| Eptesicus nilssoni Keyserling et Blasius, 1839 | Кожанок северный | 3 |
| Cygnus cygnus (Linnaeus, 1758) | Лебедь-кликун | 1 |
| Circus pygargus (Linnaeus, 1758) | Луговой лунь | 2 |
| Accipiter virgatus (Temminck, 1822) | Малый перепелятник | 4 |
| Stenodus leucichthys nelma Pallas, 1773 | Нельма | 2 |
| Aquila pennatus (Gmelin, 1788) | Орел-карлик | 3 |
| Aquila clanga Pallas, 1811 | Подорлик большой | 1 |
| Lutra lutra (Linnaeus, 1758) | Речная выдра | 5 |
| Grus grus (Linnaeus, 1758) | Серый журавль | 2 |
| Acipenser baerii Brandt, 1869 | Сибирский осетр | 1 |
| Pandion haliaetus (Linnaeus, 1758) | Скопа | 1 |
| Falco peregrinus (Gmelin, 1788) | Сокол - сапсан | 3 |
| Hirundapus caudacutus (Latham, 1802) | Стриж колючехвостый или иглохвостый | 3 |
| Murina leucogaster Milne-Edwards, 1872 | Трубконос большой | 3 |
| Plecotus auritus | Ушан обыкновенный | 3 |
| Bubo bubo (Linnaeus, 1758) | Филин | 1 |
| Pernis ptilorhynchus (Temminck, 1821) | Xоxлатый осоед | 4 |
| Cicadetta montana Scopoli, 1772 | Цикада горная | 3 |
| Grus monacha (Temminck, 1835) | Черный журавль | 1 |
| Ciconia nigra (Linnaeus, 1758) | Черный аист | 3 |
| Podiceps cristatus (Linnaeus, 1758) | Чомга | 3 |
| Bombus paradoxus Dalla Torre, 1882 | Шмель необычный | 3 |
| Bombus modestus Eversmann, 1852 | Шмель скромный | 3 |
| Bombus sporadicus Nylander, 1848 | Шмель спорадикус | 2 |
| Латинское название | Русское название | Категория охраны |
| Cypripedium guttatum Sw. | Башмачок капельный | 3 |
| Cypripedium macranthоn Sw. | Башмачок крупноцветковый | 2 |
| Botrychium lunaria (L.) Sw. | Гроздовник полулунный | 3 |
| Inula helenium L. | Девясил высокий | 2 |
| Epipactis palustris (L.) Crantz | Дремлик болотный | 3 |
| Hemerocallis lilio-asphodelus L. | Красоднев желтый | 3 |
| Nuphar pumila (Timm) DC. | Кубышка малая | 3 |
| Nemphaea tetragona Georgi | Кувшинка четырехгранная | 3 |
| Tilia sibirica Fischer ex Bayer | Липа сибирская | 2 |
| Platanthera bifolia (L. ) Rich. | Любка двулистная | 3 |
| Polystichum braunii (Spenn.) Fee | Многорядник Брауна | 2 |
| Malaxis monophyllos (L.) Sw. | Мякотница однолистная | 3 |
| Poa remota Forsell. | Мятлик расставленнй | 3 |
| Osmorhiza aristata (Thunb.) Rydb. | Осмориза остистая | 2 |
| Dactylorhiza baltica (Klinge) Orlova | Пальцекорник балтийский | 2 |
| Dactylorhiza incarnata (L.) Soo | Пальцекорник мясокрасный | 3 |
| Dactylorhiza incarnata (L.) Soó | Пальчатокоренник мясокрасный | 3 |
| Dactyloriza fuchsii (Druce) Soo | Пальцекорник Фукса | 3 |
| Dactylorhiza cruenta (Muell.) Soo | Пальцекорник кровавый | 3 |
| Sanicula europaea L. | Подлесник европейский | 3 |
| Salvinia natans (L.) All. | Сальвиния плавающая | 3 |
| Listera ovata (L.) R.Br. | Тайник яйцевидный | 3 |